湖北醫藥學院成立于1965年，原名武漢醫學院鄖陽分院，1977年開始普通本科教育，1986年更名為同濟醫科大學鄖陽醫學院，1994年獨立設置定名為鄖陽醫學院，1995年開始聯合培養碩士研究生；2010年經教育部批準更名為湖北醫藥學院。
2013年被國務院學位委員會批準為碩士學位授予單位，同年開始辦研究生層次留學生教育；2017年10月，學校在深圳創建臨床學院，深圳坪山醫院成為湖北醫藥學院第八臨床學院。
在學科建設方面，湖北醫藥學院據2019年1月學校官網顯示，該校有一級學科碩士點4個、專業學位碩士授權點5個、省級重點一級學科3個、“楚天學者計劃”設崗學科8個。該校有國家特色建設專業2個、省級本科品牌專業5個、省級精品課程7門、省級教學示范中心3個。